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Deep learning33

1-1.Introduction to medical image classification 이번부터 4주간 classification에 대해서 알아볼 것. 1. 먼저 의료영상에서 분류가 어떻게 활용되는지 살펴보고 2. 공부하게 될 기법 간단 소개할 예정 로지스틱,뉴럴네트워크등의 머신러닝 분야에서 전통적으로 사용되던 분류기법 살펴보고 영상 분류문제에 이런 기법들이 어케 사용되는지 살펴볼것 3. Demographic score라고 하는 환자정보들을 의료영상 분류에 효과적으로 이용하기 위한 방법 살펴볼 것 뇌 영상의 분류문제 다른 부위도 비슷하게 분류 가능 좌 : 정상 중 : 경도인지장애 우 : 치매환자 white matter(내), gray matter(외곽), CSF(검은부분) 알츠하이머-디지즈는 gray matter가 안보임. 노말에 비해 비어보임 벤트리컬(뇌 가운데 공간) 부위가 커져있다. .. 2020. 7. 1.
1-7. Magnetic Resonance Imaging (MRI) 마지막으로 MRI에 대해 알아보자 Magnetic Resonance Imaging Resonance : 공명현상 원리 : 몸 안에는 수소원자핵(물)들이 많이 있다. 처음에는 이 핵들이 랜덤한 방향을 가지고 있다. 이 부분에 강향 마그네틱 필드(노란색)를 걸어주게 되면 (1.5T 스캐너, 3T스캐너... 자기장의 크기 의미) 수소원자핵들이 다음과 같이, 같은(한) 방향을 가리킨다. 지구 자전처럼 돈다(세차운동). 자기장에 따라 도는 속도가 다르다. 세차운동 속도를 계산하는 식이 있음. 특정속도만큼의 RF pulse주게되면 ㅡ이 frequency와 같은 파장의 radio prequency 신호를 주게 되면 공명현상이 일어나게 된다. 1. 자기장 걸어주면 처음에는 같은 방향을 가리킴 2. RF pulse 주게.. 2020. 6. 15.
1-6. X-ray / CT / PET 본 차시에서는 X-ray / CT / PET원리 살펴볼 것. X-ray 이미징 하려면 light source필요함 여기선 X-tube가 된다. 에너지 커서 몸 통과하고 통과된 신호를 detector에서 받아들임 우측은 detector 확대한 것 뼈는 X-ray가 덜 통과되서 Intensity 낮고 폐 부분은 다른 곳에 비해서 높다 이 Intensity 차이를 바탕으로 영상을 만들어 낼 수 있다. 뼈는 밝고 폐 부분은 어둡다 디텍터는 X-ray를 전기신호로 바꿔주는 역할한다. 전기신호의 차이로 영상을 만들어 내는 것. CT endoscopy나 현미경, X-ray는 2D영상 여기서부터는 3D영상 CT는 X-ray원리는 그대로 이용하고 여기에 컴퓨팅 작업이 들어가게 된다. 컴퓨팅을 통해서 여러장의 2D이미지들.. 2020. 6. 4.
1-5. Image acquisition 이미지를 취득하는 부분에 대해서 살펴보자 자세한 내용까지는 많아서 못다룸 여기서는 기본적인 원리만 살펴볼 것. 왼쪽에 보이는 다양한 기법들이 어떻게 동작하는지 원리를 살펴볼 예정. 다음주차부터 배우게 될 CT,MR,병리현상에서 오늘 수업을 예로 들 수 있음. 여기서 언급하지는 않지만 Ultra sound, OCT(optical coherence tomograpy) 이미지 기법들은 병원에서 많이 사용된다 - Ultra sound : 태아 상태 보는 초음파 사용, 심장 초음파(방사선 쬐지 않으면서 간단하게 몸 내부 볼수있는 장점) - OCT : 영상은 안구의 3D 구조를 보는데 사용가능 먼저 영상이 어떻게 취득되는지 이해를 해보자 카메라로 영상 찍으면, 그 영상이 취득이 된다. 그 원리는 1. light s.. 2020. 6. 4.
1-4. PACS/DICOM/Visualization 의료영상 분석 전에, 의료영상의 어떻게 1. 취득되고 2. 서버에 저장되고 3. 의사들에게 어떻게 보여지는지 이해하고 있을 필요가 있다 본 차시에서는 이거 살펴보겠다 병원에는 위와 같은 시스템이 깔려있다 PACS 중앙에 서버가 있고, 서버에 모든 정보들이 저장된다. 장비들로부터 의료영상들(MRI, X-Ray, CT)이 취득되고, 이 영상들은 DICOM 포맷으로 변환된다. 그 후 PACS에 저장된다. 의사들이 이 영상을 확인하고 싶을때 불러올수 있고, 서버에서 visualization되어 제공되는 것이다 DICOM형식에 대해 알아보자 RSNA(북미 방사선학회)에서 1992~3년에서 메디컬이미지에 대한 국제표준 정했다. 이 표준안에는 1. 영상뿐아니라 2. 통신을 위한 정보가 들어가있고, 3. 간단한 cli.. 2020. 6. 4.
1-3. Introduction to medical image analysis 출처 edwith - boostcourse https://www.edwith.org/medical-20200327/joinLectures/30437 1. 의료영상이 컴퓨터비전과 머신러닝과 연관이 많다 했는데, 어떤 연관이 있는지 -> 각각의 문제를 해결하기 위한 도구임 2. 인공지능 뭔지 개념먼저 -> 문제를 해결하기 위한 방법(classification, segmentation, enhancement, registration) 3. 어떻게 머신러닝 나오고 딥러닝 최근 나왔는데 어떤 연관있는지 -> 머신러닝 : 컴퓨터가 스스로 문제 해결하도록 하기 위한 방법 -> 딥러닝 : 데이터가 많아지고 컴퓨터 사양이 좋아지면서 복잡한 딥러닝 사용 가능해짐 Aritificial Inteligent = AI 1950년.. 2020. 6. 3.